Benedikt von Peter studierte in Bonn Musikwissenschaft, Germanistik, Jura und Gesang. Danach war er an verschiedenen Häusern Regieassistent und gründete ein freies Theaterkollektiv. Nach einigen Jahren in der freien Szene inszenierte er an Opernhäusern und Theatern in Deutschland, Österreich und der Schweiz (u. a. Oper Frankfurt, Staatsoper Hannover, Komische Oper Berlin, Deutsche Oper Berlin und Wiener Festwochen). Von 2012 bis 2016 leitete Benedikt von Peter die Musiktheatersparte des Theater Bremen. Ausgezeichnet wurde er mit dem Götz-Friedrich-Preis, dem Theaterpreis ‹Der Faust› sowie 2014 mit dem Kurt-Hübner-Preis für das Musiktheater-Programm und die eigenen Produktionen am Theater Bremen. Von 2016 bis 2021 war Benedikt von Peter Intendant des Luzerner Theater. Seit der Spielzeit 2020/21 ist er Intendant und Künstlerischer Leiter der Oper am Theater Basel.

Ein Schwerpunkt seiner künstlerischen Arbeit liegt auf dem Verhältnis von Theater, Raum und Publikum. Seine Inszenierungen, etwa ‹Aufstieg und Fall der Stadt Mahagonny› oder ‹Intolleranza 1960›, hinterfragen die Trennung von Bühne und Zuschauerraum und entwickeln Musiktheater als gemeinsame körperliche Erfahrung im Raum. Durch begehbare Raumkonzepte entsteht Theater als sozialer Ort, an dem Kunst nicht nur betrachtet, sondern kollektiv erlebt wird. 

Diese Haltung prägt auch sein Verständnis von Theater als Institution. Am Theater Basel gestaltet er seit 2020 gemeinsam mit seinem Team strukturellestrukturelle Veränderungsprozesse hin zu einer stärkeren Öffnung des Hauses. Das von ihm initiierte Foyer Public versteht er als erweiterten Theaterraum und öffentlichen Stadtraum zugleich: ein konsumfreier Ort der Begegnung und eine Bühne für menschliches Verhalten. Hier wird gesellschaftliches Zusammenleben sichtbar und verhandelbar als Teil eines Theaters, das sich nicht als Repräsentationsort, sondern als offene Werkstatt gemeinsamer Erfahrung begreift.